98年8月8日莫拉克颱風來襲，為台灣中南部山區帶來了兩千多毫米的雨量，阿里山地區24、48及72小時累積雨量分別為1,623.5毫米、2,361毫米及2,854毫米，為台灣歷年之冠，其中，24及48小時降雨量甚至逼近世界降雨量極值（分別為1,825毫米及2,467毫米），另依據高屏溪九曲測站量測尖峰水流流量29,100cms，曾文溪溪港大橋站13,015cms，推估本次河川流量應為台灣200年來第一大流量。
由於山區地質脆弱與地形陡峭，加上堆積於河床的砂石，阻礙惡水之宣洩，罕見的山崩、堰塞湖潰堤等現象驟然發生，釀成了台灣中南部嚴重的災情，造成699人死亡或失蹤，1,764棟房屋毀損；河川流域淹水總面積約13,304公頃，排水洪災總淹水面積約達83,220公頃；淹水50cm以上戶數共140,424戶；經濟損失約1998.3億元。政府第一時間搶救，出動國軍54萬5,196人次，警義消99萬3,147人次，調度直升機5,958架次，救出災民53,442人，運送物資503,953噸，清運土石垃圾329,608噸，消毒面積8,212萬平方公尺。
為加速展開各項重建工作，行政院依據「災害防救法」第37條第1 項規定，於莫拉克颱風災後7天（98 年8 月15 日）成立「行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會」(以下簡稱重建會)，專責主導條例中並明訂之家園重建、基礎建設重建、產業重建、生活重建、文化重建等計畫，加速災區重建工作。另外，行政院於災後12日(98年8月20日)通過「莫拉克颱風災後重建特別條例」（以下簡稱特別條例）草案，送請立法院審議，經立法院8月27日三讀通過， 總統8月28日公布，行政及立法部門共同攜手，在災後20日內即完成特別條例立法，不僅展現卓越的行政效能，並為救災工作奠定完備法制基礎。
災後重建經費方面，立法院98年11月10日三讀通過預算1,165.08億元，另於特別預算通過前，行政院依據「災害防救法」先行移緩濟急計220.38億元，總計重建經費1,385.46億元。民間善款方面，截至100年9月10日，計有政府單位24個，實募金額115億368萬餘元，民間單位56個，實募金額136億6,146萬餘元，合計251億6,515萬餘元。
自98年8月啟動重建工作，迄今災區基礎建設復建、家園重建及產業發展已有具體成果，以下將就各項工作成果提出說明。
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